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本校於民國59年8月1日成立，原為『澎湖縣立湖西國民中學沙港分部』，至民國64年8月1日獨立正名為『澎湖縣立志清國民中學』，歷經洪昭義先生創校，歷任校長經營規劃，樹立和諧樸實校風。民國105年8月1日王世桓校長到任後，承續優良傳統，積極推動和諧校園，共同參與，改善教學環境，爭取社會資源，加強生活教育、品德教育，提升學生學習成就，參與校外各項活動比賽，使學校不斷進步與發展，呈現生機氣象。

本校現有員工9名，校長1名和領域教師4名、專長教師2名、職工2名。班級數有2班，學生人數八年級2名、九年級6名共8名，校地面積計1.79公頃，校園綠樹成蔭，環境幽雅，是啟迪學生心智、變化氣質的優良學府。